Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pkp4Q68FH0 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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