Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sbno1Q689Z5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms