Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trim24Q64127 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trim24Q64127 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trim24Q64127 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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