Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Col4a5Q63ZW6 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Col4a5Q63ZW6 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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