Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Sall3Q62255 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Sall3Q62255 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms