Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

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Length 760 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sema4aQ62178 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sema4aQ62178 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sema4aQ62178 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sema4aQ62178 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema4aQ62178 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema4aQ62178 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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