Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

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Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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Ifi47Q61635 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ifi47Q61635 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ifi47Q61635 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ifi47Q61635 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ifi47Q61635 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ifi47Q61635 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Ifi47Q61635 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Ifi47Q61635 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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Ifi47Q61635 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ifi47Q61635 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Ifi47Q61635 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Ifi47Q61635 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms