Protein–RNA interactions for Protein: Q61457

Ccne1, G1/S-specific cyclin-E1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne1Q61457 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccne1Q61457 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms