Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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PcolceQ61398 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PcolceQ61398 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms