Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Traf3Q60803 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Traf3Q60803 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms