Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Cts3-202ENSMUST00000223815 1367 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Foxd4Q60688 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm45587-201ENSMUST00000211548 765 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Speer4c-201ENSMUST00000095005 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Speer4d-201ENSMUST00000095006 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Mir466f-2-201ENSMUST00000104805 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm44582-201ENSMUST00000209125 445 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Foxd4Q60688 AC133598.4-201ENSMUST00000224577 454 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms