Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prdm1Q60636 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prdm1Q60636 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms