Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.75
Utp20Q5XG71 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Utp20Q5XG71 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms