Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 AC138290.1-201ENSMUST00000219242 820 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 AC154616.1-201ENSMUST00000226995 804 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Phf12Q5SPL2 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms