Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Olfr464-204ENSMUST00000216461 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
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Trappc1Q5NCF2 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.92
Trappc1Q5NCF2 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
Trappc1Q5NCF2 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
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