Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim58Q5NCC9 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trim58Q5NCC9 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms