Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Lrrc47Q505F5 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms