Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Prpf38aQ4FK66 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Prpf38aQ4FK66 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms