Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Srp54a-207ENSMUST00000110708 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
H2al1nQ497L1 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Plekha7-202ENSMUST00000181981 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
H2al1nQ497L1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms