Protein–RNA interactions for Protein: Q3US16

Tceanc, Transcription elongation factor A N-terminal and central domain-containing protein, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TceancQ3US16 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
TceancQ3US16 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
TceancQ3US16 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms