Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
E130208F15RikQ3UPV3 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms