Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Nhlrc4Q3UP44 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms