Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms