Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Fam83a-201ENSMUST00000050374 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm26989-201ENSMUST00000182608 749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Zswim8Q3UHH1 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zswim8Q3UHH1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zswim8Q3UHH1 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Zswim8Q3UHH1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms