Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Spata9-201ENSMUST00000022081 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Gtpbp6Q3U6U5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Mndal-204ENSMUST00000188804 2026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtpbp6Q3U6U5 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fabp12-204ENSMUST00000172126 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtpbp6Q3U6U5 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Gtpbp6Q3U6U5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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