Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Q3U595 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Q3U595 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Q3U595 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms