Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Tmem35bQ3U0Y2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.2 ms