Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Trappc9Q3U0M1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms