Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

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Length 965 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tbc1d2bQ3U0J8 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Tbc1d2bQ3U0J8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms