Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Pnpla6Q3TRM4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms