Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ctdnep1Q3TP92 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ctdnep1Q3TP92 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Ctdnep1Q3TP92 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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