Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm4366-201ENSMUST00000201488 1342 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Smrp1Q2MH31 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Smrp1Q2MH31 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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