Protein–RNA interactions for Protein: Q1JRP2

Tmprss11c, Transmembrane protease serine 11C, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss11cQ1JRP2 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Tmprss11cQ1JRP2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tmprss11cQ1JRP2 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tmprss11cQ1JRP2 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Tmprss11cQ1JRP2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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