Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Rpusd3Q14AI6 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rpusd3Q14AI6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rpusd3Q14AI6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
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