Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Traf3ip1Q149C2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms