Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc39dQ0VF76 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc39dQ0VF76 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms