Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ttc21bQ0HA38 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms