Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
MitfQ08874 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
MitfQ08874 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms