Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Tgm3Q08189 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms