Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Siah1bQ06985 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Siah1bQ06985 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms