Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cab39Q06138 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms