Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc2Q05020 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms