Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snai1Q02085 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snai1Q02085 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms