Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ascl1Q02067 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms