Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Hoxd1Q01822 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Hoxd1Q01822 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms