Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Rbp4Q00724 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms