Protein–RNA interactions for Protein: Q00690

Sele, E-selectin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeleQ00690 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
SeleQ00690 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms