Protein–RNA interactions for Protein: P97477

Aurka, Aurora kinase A, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkaP97477 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
AurkaP97477 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
AurkaP97477 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms