Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Pitx2P97474 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Pitx2P97474 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms