Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Pkp1P97350 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Pkp1P97350 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pkp1P97350 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pkp1P97350 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms